Die Quellflüsse des Amazonas entspringen in den peruanischen Anden. Von der brasilianischen Grenze bis zur Höhe der Stadt Manaus heisst der Fluss dann "Rio Solimões". Dort trifft der Rio Solimões auf den Rio Negro, der von Norden her in das Amazonasbecken strömt. Dieser Ort, wo die beiden Flüsse sich zum Amazonas vereinigen, heisst auf portugiesisch "Encontro das Águas" (Zusammentreffen der Wasser).
Die physikalischen (Fliessgeschwindigkeit, Temperatur, Dichte) und chemischen (Zusammensetzung, pH-Wert) Eigenschaften der beiden Flüsse unterscheiden sich stark.