In der Geologie ist ein Hotspot ein Gebiet, in dem Magma aus der Tiefe aufsteigt. Der Hotspot bewegt sich im geologischen Zeitverlauf nicht. Wenn auf einer tektonischen Platte mehrere Vulkane von zunehmendem Alter in einer Reihe liegen, zeigt dies, dass die Platte im Lauf der Zeit über einen oder mehrere Hotspots gewandert ist.

Hotspots der Biodiversität sind Regionen der Erde mit einer grossen Zahl endemischer, also nur dort vorkommender Tier- und Pflanzenarten. Oft sind Hotspots sehr anfällig auf menschliche Einflüsse und daher von der Zerstörung bedroht.